Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms