Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKIRAS1Q9NYS0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms