Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXC10Q9NYD6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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