Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARD6AQ9NPB6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms