Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GOPCQ9HD26 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GOPCQ9HD26 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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