Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOJQ9H4E5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOJQ9H4E5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOJQ9H4E5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOJQ9H4E5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOJQ9H4E5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOJQ9H4E5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOJQ9H4E5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOJQ9H4E5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOJQ9H4E5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOJQ9H4E5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOJQ9H4E5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms