Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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C20orf27Q9GZN8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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C20orf27Q9GZN8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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C20orf27Q9GZN8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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C20orf27Q9GZN8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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C20orf27Q9GZN8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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C20orf27Q9GZN8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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C20orf27Q9GZN8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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C20orf27Q9GZN8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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C20orf27Q9GZN8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C20orf27Q9GZN8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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C20orf27Q9GZN8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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