Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE41Q9C0J9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms