Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CEP44Q9C0F1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms