Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SRRTQ9BXP5 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms