Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLVAPQ9BX97 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms