Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HIRIP3Q9BW71 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIRIP3Q9BW71 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms