Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CRACR2AQ9BSW2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms