Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RTKNQ9BST9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms