Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SGIP1Q9BQI5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms