Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HINFPQ9BQA5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms