Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TREX2Q9BQ50 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms