Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SEMA3CQ99985 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA3CQ99985 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms