Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTPN18Q99952 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms