Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SORT1Q99523 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SORT1Q99523 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms