Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms