Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CAPNS2Q96L46 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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