Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRIQ1Q96JM4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRIQ1Q96JM4 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms