Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COG3Q96JB2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms