Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms