Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ELP4Q96EB1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms