Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN23Q96B33 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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