Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
BHMTQ93088 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BHMTQ93088 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms