Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF548Q8NEK5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ZNF548Q8NEK5 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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