Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC112Q8NEF3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms