Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFSD9Q8NBP5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms