Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HAPLN4Q86UW8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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