Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF550Q7Z398 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms