Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OTOP1Q7RTM1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
OTOP1Q7RTM1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms