Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRINP3Q76B58 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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