Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC174Q6PII3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC174Q6PII3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms