Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NANOGP8Q6NSW7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms