Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNS3Q68CZ2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNS3Q68CZ2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNS3Q68CZ2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNS3Q68CZ2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNS3Q68CZ2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms