Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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PRAMEF20Q5VT98 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF20Q5VT98 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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