Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIF1Q5UIP0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms