Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEP170Q5SW79 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms