Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PERM1Q5SV97 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms