Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SDK2Q58EX2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SDK2Q58EX2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms