Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NBPF8Q3BBV2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NBPF8Q3BBV2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms