Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NDUFAF6Q330K2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NDUFAF6Q330K2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms