Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL38Q2WGJ6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms