Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PFKFB3Q16875 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms