Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LAMA3Q16787 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LAMA3Q16787 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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