Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PDK4Q16654 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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PDK4Q16654 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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PDK4Q16654 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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PDK4Q16654 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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PDK4Q16654 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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PDK4Q16654 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDK4Q16654 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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