Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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